Preview

Journal of Siberian Medical Sciences

Расширенный поиск

Сравнительная оценка логистической регрессии и дерева решений в прогнозировании рецидива у больных туберкулезом органов дыхания с множественной лекарственной устойчивостью возбудителя

https://doi.org/10.31549/2542-1174-2022-6-4-99-111

Аннотация

   Введение. Частота рецидивов туберкулеза (ТБ) органов дыхания является одним из показателей, характеризующих эффективность проводимых противотуберкулезных мероприятий. Своевременное выявление больных с рецидивами является одним из приоритетных подходов в решении этой проблемы. В настоящее время с внедрением технологий обработки больших массивов данных, а именно искусственного интеллекта, применяют различные классификаторы, учитывающие совокупность выявляемых у пациентов признаков. Алгоритм «дерево решений» достаточно хорошо зарекомендовал себя в медицинской аналитике. С его помощью можно классифицировать состояние здоровья обследуемых и выявлять первые признаки рецидива туберкулезного процесса.
   Цель исследования. Разработать и провести сравнительную оценку моделей прогнозирования рецидива у больных туберкулезом легких с множественной лекарственной устойчивостью возбудителя (МЛУ-ТБ) с
применением математических технологий – логистической регрессии и дерева решений.
   Материалы и методы. В исследование включены клинико-эпидемиологические, возрастно-половые, социальные, медико-биологические данные 346 пациентов МЛУ-ТБ, которые эффективно завершили курс химиотерапии. Были сформированы две группы наблюдения в зависимости от наступления у пациентов рецидива заболевания в течение как минимум пятилетнего срока наблюдения – основная (35 чел., рецидив ТБ) и контрольная (311 чел., без рецидива) соответственно. Статистическая обработка данных для модели логистической регрессии проводилась в программе IBM SPSS Statistics 23.0; для классификатора на основе дерева решений – в библиотеке Scikit-learn 0.24.2 в интерактивной облачной среде с программным кодом Google Colaboratory с использованием К-блочной стратифицированной проверки. Количественная интерпретация результатов прогнозирования
проводилась по ROC-кривым с оценкой показателя AUC и статистических показателей диагностического теста – чувствительности и специфичности.
   Результаты. Чувствительность и специфичность модели логистической регрессии и классификатора на основе дерева решений для прогнозирования рецидива туберкулеза составили 98.7 %, 88.6 % и 74.0 %, 97.0 % соответственно.
   Заключение. Созданные модели могут стать инструментом прогнозирования рецидива у излеченных больных МЛУ-ТБ.

Об авторах

А. С. Аллилуев
ОГАУЗ «Томский фтизиопульмонологический медицинский центр»
Россия

Александр Сергеевич Аллилуев, канд. мед. наук, заместитель главного врача по организационно-методической работе

634009

ул. Розы Люксембург, 17

Томск



О. В. Филинюк
Минздрав России
Россия

Ольга Владимировна Филинюк, д-р мед. наук, профессор, заведующий кафедрой

ФГБОУ ВО «Сибирский государственный медицинский университет»

кафедра фтизиатрии и пульмонологии

Томск



С. В. Аксенов
Минздрав России; ФГАОУ ВО «Национальный исследовательский Томский политехнический университет»
Россия

Сергей Владимирович Аксенов, канд. техн. наук, доцент, доцент кафедры

ФГБОУ ВО «Сибирский государственный медицинский университет»

кафедра медицинской и биологической кибернетики

Инженерная школа информационных технологий и робототехники 

отделение информационных технологий

кафедра теоретических основ информатики

Томск



Е. Е. Шнайдер
ОГАУЗ «Томский фтизиопульмонологический медицинский центр»
Россия

Екатерина Евгеньевна Шнайдер, врач-статистик

организационно-методический отдел

Томск



Д. Е. Филинюк
ФГАОУ ВО «Национальный исследовательский Томский политехнический университет»
Россия

Даниил Евгеньевич Филинюк, студент

Инженерная школа информационных технологий и робототехники

Томск



Ю. А. Логинова
Минздрав России
Россия

Юлия Александровна Логинова, ординатор

ФГБОУ ВО «Сибирский государственный медицинский университет»

кафедра фтизиатрии и пульмонологии

Томск



Список литературы

1. Global tuberculosis report 2021. Geneva: World Health Organization, 2021. Licence: CC BY-NC-SA 3.0 IGO.

2. Ресурсы и деятельность противотуберкулезных организаций Российской Федерации в 2019–2020 гг. (статистические материалы) / О. Б. Нечаева [и др.] – М.: РИО ЦНИИОИЗ, 2021. – 112 с.

3. Пьянзова Т. В. Клиническая характеристика рецидивов туберкулезного процесса в Кемеровской области / Т. В. Пьянзова [и др.] // Туберкулез и болезни легких. – 2013. – 9: 25-28.

4. Рукосуева О. В. Особенности течения и диагностики рецидивов туберкулеза легких / О. В. Рукосуева [и др.] // Туберкулез и болезни легких. – 2011. – 7: 138-139.

5. Сагалбаева Т. Ж. Причины формирования и структура клинических форм туберкулеза ранних и поздних рецидивов заболевания / Т. Ж. Сагалбаева [и др.] // Туберкулез и болезни легких. – 2015. – 5: 163-164.

6. Шарашова Е. Е. Применение множественного логистического регрессионного анализа в здравоохранении с использованием пакета статистических программ SPSS Е. Е. Шарашова [и др.] // Наука и здравоохранение. – 2017. – 4: 5-26.

7. Наркевич А. Н. Интеллектуальные методы анализа данных в биомедицинских исследованиях: деревья классификации / А. Н. Наркевич, К. А. Виноградов, А. М. Гржибовский // Экология человека. – 2021. –3: 54-64.

8. Mello F. C. d. Q., Bastos L. G. d. V., Soares S. L. M. et al. Predicting smear negative pulmonary tuberculosis with classifi cation trees and logistic regression: a cross-sectional study // BMC Public Health. 2006;6:43. DOI: 10.1186/1471-2458-6-43.

9. Aguiar F. S., Almeida L. L., Ruffi no-Netto A. et al. Classification and regression tree (CART) model to predict pulmonary tuberculosis in hospitalized patients // BMC Pulm Med. 2012; 12: 40. DOI: 10.1186/1471-2466-12-40.

10. Kalhori S. R. N., Zeng X. J. Evaluation and comparison of diff erent machine learning methods to predict outcome of tuberculosis treatment course // J. Intell. Learn. Syst. Appl. 2013; 5: 10.

11. Tan D., Wang B., Li X. et al. Identification of risk factors of multidrug-resistant tuberculosis by using classification tree method // Am. J. Trop. Med. Hyg. 2017; 97 (6): 1720-1725. DOI: 10.4269/ajtmh.17-0029.

12. Kulkarni V., Queiroz A. T. L., Sangle S. et al. A two-gene signature for tuberculosis diagnosis in persons with advanced HIV // Front. Immunol. 2021; 12: 631165. DOI: 10.3389/fimmu.2021.631165.


Рецензия

Для цитирования:


Аллилуев А.С., Филинюк О.В., Аксенов С.В., Шнайдер Е.Е., Филинюк Д.Е., Логинова Ю.А. Сравнительная оценка логистической регрессии и дерева решений в прогнозировании рецидива у больных туберкулезом органов дыхания с множественной лекарственной устойчивостью возбудителя. Journal of Siberian Medical Sciences. 2022;(4):99-111. https://doi.org/10.31549/2542-1174-2022-6-4-99-111

For citation:


Alliluev A.S., Filinyuk O.V., Аksenov S.V., Shnayder E.E., Filinyuk D.E., Loginova Yu.A. Comparative evaluation of logistic regression and decision tree in predicting multidrug-resistant tuberculosis recurrence. Journal of Siberian Medical Sciences. 2022;(4):99-111. https://doi.org/10.31549/2542-1174-2022-6-4-99-111

Просмотров: 223


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2542-1174 (Print)